日语系是与深圳大学这所特区窗口大学共同成长起来的。1983年开始面向全校的日语教学，1995年正式建系，每年招收本科生40-50名。是深圳市日语专业人才培养基地。2012年设立硕士点，每年招收日语语言、文学文化、日语教育三个研究方向的6-8名学生。
本系现有专任教师14人，其中教授1人，副教授4人，讲师6人，助理教授3人。教师学历层次高，其中11名教师有博士学位，3名教师有硕士学位。毕业于大阪大学、京都大学、北京大学、南开大学等国内外名校。所有教师均有留学或访学日本的经历。教师研究方向均衡且多样化，文学、语言学、历史学、教育学、社会学等各方向相互借鉴相互支撑，为开设高质量多样化的专业课程提供了保障。科研方面，本系教师研究成果取得长足的进步，主持国家社科、教育部人文社科、深圳市各类纵横向基金项目多项，在国内外学术刊物上发表论文数十篇，出版学术专著和译著多部。
本系实施“零起点”教学，采取“语言技能+专业方向”培养模式，小班教学，注重“听说读写”基本功的学习与训练，培养实用技能型人才的同时注重学生人文修养的熏陶，开设了日语语言学基础、日本文学文化概论、日本文学经典选读、日本历史、日本哲学思想等丰富的人文修养类核心课程和创新型短课，丰富学生的知识结构，培养学生的国际化视野和研究思考能力。2016年6月本系成立了东亚研究中心，立足深圳，服务地区，放眼东亚与世界，积极探索新时期东亚研究的新路径。中心大力建设专业图书资料，定期举行读书会，每年邀请海内外知名学者和青年学人为师生进行学术讲座和交流，拓展学生视野，培养学生一定的学术思维和研究意识。
本系的国际化建设开展早、途径多。1.与日本明治大学、立命馆大学、大阪大学、大分大学、神奈川大学、早稻田大学、大阪市立大学等多所日本名校建立了友好交流，每年派遣交换留学生赴日留学，为期半年至一年；2.与札幌大学合作建立了2+2双学位双校园培养项目，四年两地双学位，培养日语+的复合型人才；3.与日本九州外国语学校合作建立了日本读研辅导培训基地，为学生赴日申研深造提供辅导和渠道。
本系毕业生就业率高，主要活跃在深圳及广东省的各日资企业、商社、银行、文化机构等，在用人市场上，其竞争力优于国内一些“985”、“211”高校。据麦可思报告显示，日语系校友推荐度和校友满意度分别为100%和97%。用人单位评价本系毕业生总体上综合素质高，踏实能干且有一定的创新精神。
